Ce qu’il faut savoir sur la variante bêta du coronavirus

• La variante bêta du coronavirus identifiée pour la première fois en Afrique du Sud peut avoir causé une maladie plus grave lors de la deuxième vague du pays, mais d’autres facteurs peuvent avoir été impliqués.
• Les chercheurs ont examiné les données d’admission de patients COVID-19 de plus de 644 hôpitaux sud-africains entre mars 2020 et mars 2021, ainsi que le nombre de cas de coronavirus au cours de cette période.
• Les chercheurs ont découvert que lors de la deuxième vague, lorsque la variante bêta était plus courante, les cas de COVID-19, les hospitalisations et les décès à l’hôpital étaient tous plus élevés que lors de la première vague, lorsque la variante alpha était plus courante.

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Au cours de la deuxième vague de la pandémie en Afrique du Sud, les cas de COVID-19, les hospitalisations et les décès à l’hôpital étaient tous plus élevés que lors de la première, selon une nouvelle étude.

Cela survient à un moment où la variante bêta du coronavirus est prédominante dans le pays, ont écrit les auteurs le 9 juillet, suggérant qu' »une nouvelle lignée (bêta) en Afrique du Sud pourrait être associée à une augmentation de la mortalité hospitalière lors de la deuxième vague ». . » Dans The Lancet Global Health.

Cependant, ils ont souligné les limites de l’étude. De plus, d’autres facteurs peuvent avoir contribué à une mortalité plus élevée chez les patients hospitalisés COVID-19 au cours de la deuxième vague du pays.

Une étude antérieure a révélé que la variante alpha (B.1.1.7) était associée à des taux d’hospitalisation et de mortalité plus élevés au Royaume-Uni. Mais on sait peu de choses sur la question de savoir si les variantes bêta provoquent une maladie plus grave.

Dans la nouvelle étude, les chercheurs ont examiné les données sur les admissions de patients COVID-19 dans plus de 644 hôpitaux sud-africains entre mars 2020 et mars 2021, ainsi que le nombre de cas de coronavirus au cours de cette période.

La première vague en Afrique du Sud a culminé en juillet 2020 et la deuxième vague en janvier 2021. La troisième vague a commencé ce mois-ci.

La variante bêta, également connue sous le nom de B.1.351, a été découverte pour la première fois en Afrique du Sud en septembre 2020. À la deuxième vague, la variante était devenue la souche dominante dans le pays.

Les chercheurs ont découvert que le nombre de cas de COVID-19, d’hospitalisations et de décès à l’hôpital était plus élevé lors de la deuxième vague que lors de la première vague.

De nombreux facteurs affectent le risque de mourir du COVID-19 dans un hôpital, notamment un nombre élevé d’hospitalisations, ce qui peut submerger le système hospitalier.

Mais lorsque les chercheurs ont pris en compte les hospitalisations hebdomadaires, les patients COVID-19 étaient encore 31% plus susceptibles de mourir lors de la deuxième vague que lors de la première vague

Cela suggère que la variante bêta peut entraîner une maladie plus grave.

Cependant, les chercheurs ont noté qu’ils ne disposaient pas de données sur les souches des patients, il n’était donc pas possible de lier directement les pires résultats des patients à la variante bêta.

De plus, d’autres facteurs ont contribué à des taux de mortalité plus élevés au cours de la deuxième vague, comme une augmentation des hospitalisations.

« L’augmentation observée de la mortalité hospitalisée pendant les pics des première et deuxième vagues reflète en partie la pression accrue sur le système de santé », ont écrit les auteurs.

Au cours de la deuxième vague, les semaines avec des admissions « très élevées » étaient associées à une augmentation de 24 % de la mortalité par rapport aux semaines avec de faibles admissions.

Les auteurs ont ajouté : « Même les perceptions de systèmes de santé tendus peuvent contribuer à des taux de mortalité disproportionnellement élevés dus au COVID-19 et à d’autres maladies, car les individus peuvent éviter de se faire soigner jusqu’à ce que leur état clinique s’aggrave ou meurent à la maison.

Dans un éditorial d’accompagnement, le Dr Linda-Gail Bekker et le Dr Ntobeko AB Ntusi de l’Université du Cap, en Afrique du Sud, ont réitéré l’importance de maintenir la capacité hospitalière pendant la poussée de COVID-19.

« Une mesure de santé publique clé consiste à trouver des moyens d’atténuer la surpopulation grâce à une expansion rapide des installations hospitalières ou à des stratégies dites d’aplatissement de la courbe », ont-ils écrit.

Un autre moyen clé de prévenir les décès est de garantir que tous les pays ont un accès égal au vaccin COVID-19.

« La couverture vaccinale en Afrique du Sud et en Afrique dans son ensemble n’a pas encore atteint les niveaux observés dans une grande partie du reste du monde », ont écrit Becker et Ntusi. « Cela est en grande partie dû à la disponibilité des vaccins, à la disponibilité mondiale des vaccins et au nationalisme vaccinal. « 

Les variantes bêta représentent moins de 1% des cas de coronavirus aux États-Unis, selon les Centers for Disease Control and Prevention.

Certains cas de test supplémentaires continuent d’apparaître à travers le pays.

Mais étant donné la propagation rapide de la variante delta (B.1.617.2) – représentant 57,6 % des cas au cours des deux semaines terminées le 3 juillet – il est peu probable que la variante bêta se propage largement aux États-Unis.

Les taux de transmission élevés de Delta jouent également un rôle en Afrique du Sud. La variante delta domine alors que le pays combat une troisième vague de la pandémie, selon Reuters.

Les scientifiques continueront de surveiller la propagation de la bêta et d’autres variantes en analysant l’information génétique, ou le génome, d’échantillons viraux – ce que l’on appelle le séquençage du génome.

Le séquençage du génome est important pour plusieurs raisons, a déclaré le Dr Nahed Ismail, professeur de pathologie et directeur du Laboratoire de microbiologie clinique à l’Université de l’Illinois à Chicago.

La première consiste à comprendre quelles souches circulent dans la communauté.

« Nous devons empêcher ceux [coronavirus] souches qui se propagent plus agressivement que la souche de type sauvage (la souche initiale) », a déclaré Ismail. « La seule façon de déterminer celles qui se propagent plus rapidement est le séquençage. « 

Le séquençage du génome peut également avoir un impact sur les soins que les patients COVID-19 reçoivent. Certaines variantes sont résistantes aux anticorps monoclonaux qui ont reçu une approbation d’urgence de la Food and Drug Administration (FDA) des États-Unis.

« Les médecins doivent savoir quels types de mutants sont présents [in the patient’s sample] Pour choisir le bon anticorps monoclonal », a déclaré Ismail.

Les scientifiques surveillent également quelles mutations conduisent à des infections percées – celles qui surviennent chez les personnes qui ont été entièrement vaccinées contre le COVID-19.

Si une variante provoque un grand nombre de percées infectieuses graves, cela pourrait indiquer que les vaccins actuels ne sont plus efficaces contre cette souche.

La plupart des infections percées ne sont pas graves. De nombreuses personnes entièrement vaccinées ne présentent que des symptômes bénins si elles contractent le virus. Les scientifiques sont principalement préoccupés par la percée de l’infection qui entraîne l’hospitalisation de personnes atteintes de COVID-19 sévère.

Au début de la pandémie, les scientifiques recherchaient principalement des mutations dans des parties du génome contenant des instructions pour la région de pointe du coronavirus. Le virus utilise la protéine de pointe pour pénétrer dans les cellules humaines.

Mais n’importe quelle partie de l’information génétique d’un virus peut muter, de sorte que les scientifiques se sont depuis concentrés sur l’ensemble du génome.

« Ce virus est extrêmement adaptable et continue de muter », a déclaré Ismail. « Donc, si vous voulez détecter toutes les variantes, vous ne pouvez pas simplement séquencer une région, vous devez séquencer le virus entier. »

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